Ten presente que las relaciones de Categorías son automáticamente heredadas por sus "padres"/superiores, eso quiere decir que cuando seleccionas una sub-Categoría, también estás creando automáticamente una relación con su Categoría "padre"/superior (si la hubiera).

Para mayor flexibilidad, puedes optar por seleccionar solamente las sub-Categorías que desees; sin embardo, si quieres crear una relación explícita con una Categoría "padre"/superior, entonces selecciónala también.
¿Cuál es la diferencia? Si sólo seleccionas una sub-Categoría, y luego (más adelante) esa sub-Categoría es reasignada a otro "padre"/superior, entonces la relación se transferirá al nuevo "padre"/superior; sin embargo, cuando has seleccionado una Categoría ("padre"/superior), incluso si se reasigna una de sus sub-Categorías, la relación con el "padre"/superior se mantendrá.